Les enseignants-chercheurs du LECOB sont fortement impliqués dans les enseignements de Licence et Master de Sorbonne Université, dispensés sur le Campus de Jussieu et à l'Observatoire Océanologique de Banyuls. Ils assurent la coordination de plusieurs Unités d'Enseignement du MASTER de Sciences de la mer de Sorbonne Université. Certaines de ces unités d'enseignement sont proposées en langue anglaise dans le cadre du MASTER IMBRsea "International Master of Science in Marine Biological Resources" qui associe 6 universités européennes. Les enseignants-chercheurs du LECOB participent également aux Ateliers de Recherche Encadrés mis en place par Sorbonne Université en 2014 en 1ère année de Licence.